嘉靖二十九年，嘉靖皇帝做出了一个影响深远的决策：他下令将明仁宗朱高炽的牌位从太庙迁出，以便为已故皇后方氏腾出位置。这一举动，引发了朝臣们的强烈反对。根据明朝的礼制，若皇后在皇帝之前去世，她的牌位只会在皇帝去世后与皇帝一同入庙，称为“祔庙”。例如，朱棣的皇后徐氏在去世了17年后，直到朱棣去世后才得以入庙。而且，除非皇帝的原配妻子被废弃，其他的妻子无论多受宠爱，都无法进入太庙。而方皇后既不是嘉靖的原配，又在她去世时嘉靖还在世，按照规矩，完全没有理由在此时进行祔庙。此外，为了让方皇后的牌位入庙，还需要移除嘉靖一位祖宗的牌位，这更加激起了大臣们的反对之声。

然而，嘉靖对此毫不妥协，甚至斥责严嵩和徐阶说：“尔等执泥弄文，不思大义。”他的坚持并非出于对方皇后的特殊感情，而是与嘉靖时期的“大礼议”密切相关。这场关于礼制的争论肇始于正德十六年，当时明武宗朱厚照去世，他没有留下一子，堂弟朱厚熜即成为嘉靖皇帝。嘉靖刚登基时，便围绕着是否能够称呼自己的亲生父亲展开了激烈的争论。内阁首辅杨廷和等人主张，嘉靖的父亲只是藩王，皇位应由明孝宗和明武宗的血脉继承，嘉靖则坚定认为自己是根据朱元璋所定的继承顺序最正当的继承人。经过整整三年的辩论，嘉靖最终胜出，获得了对亲生父亲称谓的合法地位。

虽然“大礼议”划上了句号，但嘉靖为父母争取尊荣的努力并没有停止。在嘉靖三年的时光里，他仅仅将父亲追封为“皇考恭穆献皇帝”，这一追尊并未进入太庙。确实，嘉靖还有漫长的时光来提升父亲的谥号与地位。在接下来的岁月里，嘉靖不断提升父亲朱祐杬的谥号，最终将其谥号扩展为“知天守道洪德渊仁宽穆纯圣恭简敬文献皇帝”，并将其入庙，庙号为睿宗。更令人瞩目的是，朱祐杬的牌位在太庙中甚至高于正统皇帝朱厚照。

然而，嘉靖内心并不安宁。明朝太庙规定只有九个名额，若有新逝皇帝需要入庙，则需剔除其中一位，与其血缘关系较远的祖宗牌位得以迁出。嘉靖非常清楚，父亲的位置是通过努力获得，并非固有，未来当名额不足时，危险随时都可能降临在父亲的牌位上。因此，嘉靖深感有必要未雨绸缪，保障父亲的地位。

正因如此，嘉靖的担忧并非无的放矢。在他将父亲的牌位入庙之前，太庙供奉的皇帝包括明太祖朱元璋、明太宗朱棣、仁宗朱高炽等共八位。朱祐杬的入庙正好将名额填满，嘉靖明白，若自己去世后，必有一位皇帝的牌位必须被迁出。而根据明朝的规定，最有可能被剔除的是明仁宗朱高炽。

为避免这一局面，嘉靖希望借助方皇后的去世，来巩固父亲的地位。历史上，若皇后先于皇帝去世，通常需要等到皇帝去世之后再入庙，例如朱棣的皇后徐氏亦是如此。然而，嘉靖偏要打破这一传统，提前为方皇后祔庙。尽管这一决定不常见，但嘉靖的动机则更为深远——若方皇后提前入庙，太庙名额将急需腾出，于是嘉靖可以借此时机调整朱高炽与其父亲朱祐杬的太庙地位，以确保自己所争取的一切不会被白白抹去。